Управление АНО ДПО "Пермский центр дополнительного профессионального образования" осуществляется в соответствии с законодательством Российской Федерации и Уставом АНО ДПО "ПЦДПО".
Высшим органом управления является Учредитель. Единоличный исполнительный орган - директор Организации.
Коллегиальными органиами упраления являются: общее собрание работников Организации и педагогический совет Организации.